كان شاكر عجان يعيش في قرية يلدا، التي كانت حينها تحت سيطرة الجيش السوري الحر، ومحاصرة من قبل القوات الحكومية السورية. في 5 يناير 2014 ، وافق الجيش السوري على السماح بإخلاء جميع المدنيين الذين لم يشاركوا مباشرة في الأعمال العدائية.
في 5 يناير 2014، أثناء محاولتهم إخلاء يلدا، تم إيقاف شاكر عجان وأفراد آخرين من أسرته عند نقطة تفتيش بشارع الوحش في السيدة زينب تحت سيطرة القوات الحكومية السورية. قام أفراد من الجيش السوري بالزي العسكري باعتقال شاكر عجان وأفراد آخرين من أسرته ونقلوهم إلى مكان مجهول.
منذ اعتقاله، وأسرة شاكر عجان تقصد بشكل منتظم مركز الشرطة العسكرية في القابون بمحافظة دمشق، وكذلك المحكمة الجنائية في دمشق – آخر مرة في مايو 2019 – للاستفسار عن مصيره ومكان وجوده لكن بلا فائدة.
